Franciscus Schooten (* 1615 in Leiden, Niederlande; ? 29. Mai 1660 in Leiden) war ein niederländischer Mathematiker, der vor allem für die Popularisierung der analytischen Geometrie von René Descartes bekannt ist.

Schooten las Descartes's Géométrie (ein Anhang zu seinem Buch Discours de la méthode) bevor es publiziert wurde. Da er es schwer verständlich fand, ging er nach Frankreich um die Werke anderer Mathematiker der Zeit wie François Viète und Pierre de Fermat zu studieren. Nach seiner Rückkehr nach Leiden, wurde er Professor für Mathematik. Sein bekanntester Schüler war wohl Christiaan Huygens. Seine Kommentare zu Géométrie waren sehr wichtig, da sie das Werk breitern Schichten von Mathematikern verständlich machten. Sie waren daher mitverantwortlich für die Verbreitung der analytischen Geometrie in der Welt. Durch Schootens Arbeit wurde Leiden für eine kurze Periode in der Mitte des 17. Jahrhunderts das Zentrum der mathematischen Gemeinschaft.